La ciudad posee un gran numero de colegios con gran capacidad de estudiantes q' an logrado obtener calificaciones muy superiores dentro de los colegios del pais, en razon al buen desempeño de los estudiantes en las pruebas del estado de la educacion secundaria q' es aplicado por el istituto Colombiano para el Fomento de la Educacion Superior(ICFES), entre los q' se encuentra el Colegio Boyaca, primer colegio publico de Venezuela , Ecuador, Panama y Colombia cuando estos paises hacian parte de la Gran Colombia.
Entre los colegios mas sobresalientes se encuentran:- Escuela Normal Superior Santiago de Tunja
- American School Saint Frances
- Colegio Andino
- Colegio de la Presentacion
- Colegio Andino
- Colegio Nuestra Señora del Rosario
- Colegio Militar Juan Jose Rondon
- Escuela Normal Superior <<Leonor Alvares Pinzon>>
- Universidad Pedagogica y Tecnologica de Colombia
- Universidad Santo Tomas
- Universidad de Boyaca
- Universida Antonio Nariño
- Univesidad Juan de Castellanos
Entre otras